联合创新研究中心的定位为服务长三角一体化建设，将复旦大学、复旦大学无锡研究院的科研成果与安徽省阜阳市等地方的经济建设相结合，旨在与阜阳市建立长期稳定的产学研合作关系，发挥复旦大学的科技人才及学科优势，打造“科研创新孵化平台、高端创业项目集聚、高端人才汇聚”的联合创新研究中心。
联合创新研究中心的主要研究孵化方向包括：
1. 工业物联网与人工智能
2. 物联网与大健康技术
3. 城镇化建设与食品安全
4. 服务阜阳合肥现代产业园区相关产业发展
复旦湾谷科技园
阜阳复旦科技园
阜阳复旦科技园位于阜阳合肥现代产业园区合肥大道北侧，背靠风景秀丽的芦桥河，占地面积10万平米，其中地面面积8万平米、地下面积2万平米，作为引进和培育高科技企业和高层次人才的配套，设有科研楼、高端办公区、录播大厅、精品酒店及人才公寓，围绕“集聚高层次人才、孵化高科技项目、培育新兴产业”目标任务，致力于把创新中心打造成复旦大学国家大学科技园创新成果转化与孵化基地等资源对接平台，并力争通过3-5年的建设，把阜阳复旦科技园建成省级乃至国家级科技企业孵化器。
安徽复旦科技园创新中心是由复旦大学国家科技园在阜合园区发起设立的一家平台运营公司，成立创新中心的目的在于积极响应“长三角协同一体化发展”国家战略和深化安徽省与复旦大学的大院大所合作。创新中心依托复旦大学国家科技园的科教资源和品牌优势，是国家科创中心重要承载区和全国双创示范基地的创新实践。除阜阳总部之外，增设上海联络中心、苏州联络中心和合肥联络中心，坚实助力阜阳市融入长三角，着力载体拓展、科技转化、产业孵化、创业投资、品牌打造、政策扶持，实现阜阳复旦科技园的快速发展和转型升级。